睾丸疼痛的診斷類型非常多，包括良性病症到致命性情況。兒童時期最常見的疼痛原因是睾丸扭轉（16%），睾丸附件扭轉（46%）和附睾炎（35%）[2]。對於成人患者而言，最常見的原因是附睾炎。
睾丸扭轉
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睾丸扭轉通常為急性睾丸疼痛，出現小於六小時周期的疼痛。在進行提睾反射時候，疼痛會消失或減少[3]。在小於25歲的男性中，每年這類疼痛在4000人群中只有1例[1]，它常見於未成年人（65%發生於12至18歲患者）[4]，並很少發生於35歲以上男性人群[5]。因為這種扭轉可能在數小時後形成壞疽，所以應當進行手術性急診治療[5]。另外一種稱之為「間歇性睾丸扭轉」（intermittent testicular torsion）屬於慢性病症，因為睾丸可自行恢復原位，疼痛可在數分鐘至幾小時內自動消失，仍然需要預防和觀察。在一些情況下，睾丸扭轉會導致患者噁心和嘔吐[6]。
附睾炎
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附睾炎是指附睾（在睾丸後部的弧度結構）出現炎症。症狀通常是不同程度的持續性疼痛，陰囊可能紅腫。這通常符合尿路感染的症狀，並有一半病例是與睾丸炎有關。在14至35歲患者中，疼痛通常是由淋病或衣原體感染引起。大腸桿菌是最常見的細菌感染，治療時需要採用抗生素[5]。
佛尼爾氏症
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佛尼爾氏症（是一種會陰部位的急性感染），通常會伴有發燒和內部疼痛。這種情況很罕見，但若不及時採用外陰清創術和抗生素治療，這種疾患具有致命性[7]。
其他
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患者睾丸右側部位部分梗塞呈現出睾丸疼痛
一些其他的情況也會導致睾丸疼痛，包括有腹股溝疝、挫傷、陰囊積水、精索靜脈曲張等[8]。而睾丸癌卻是沒有疼痛的[9]。